മഴക്കാലത്ത് ചെടികൾക്ക് ആവശ്യത്തിന് ഈർപ്പം ലഭിക്കുന്നുണ്ടെങ്കിലും അമിതമായ മഴയും വെള്ളക്കെട്ടും പല ചെടികളെയും ബാധിച്ചേക്കാം. അതിനാൽ മഴക്കാലത്ത് പൂന്തോട്ട പരിപാലനത്തിൽ പ്രത്യേക ശ്രദ്ധ ആവശ്യമാണ്.

ചട്ടികളിൽ വെള്ളം കെട്ടിനിൽക്കുന്നില്ലെന്ന് ഉറപ്പാക്കണം. ഉണങ്ങിയ ഇലകളും ചീഞ്ഞ സസ്യഭാഗങ്ങളും കൃത്യമായി നീക്കം ചെയ്യുന്നത് പൂന്തോട്ടത്തിലെ ശുചിത്വം നിലനിർത്താൻ സഹായിക്കും. ഇലകളിലും തണ്ടുകളിലും പൂക്കളിലും കീടബാധയോ രോഗലക്ഷണങ്ങളോ ഉണ്ടോയെന്നും പരിശോധിക്കണം.

മഴക്കാലത്ത് വളപ്രയോഗം നടത്തുമ്പോൾ ചെടിയുടെ ഇനവും മണ്ണിന്റെ ഈർപ്പവും പരിഗണിക്കണം. രോഗബാധയോ കീടശല്യമോ ശ്രദ്ധയിൽപ്പെട്ടാൽ വിദഗ്ധരുടെ നിർദേശപ്രകാരം നിയന്ത്രണ മാർഗങ്ങൾ സ്വീകരിക്കുന്നതാണ് സുരക്ഷിതം.